中古車査定基準では、どれだけ大事に扱われた車かどうかが重視されます。考えるまでもなく、大事に乗った車は車体も内装もコンディション良好なはず。中古車と言っても、購入者は、できるだけ新車に近いコンディションの商品を求めているものです。
同様に、中古車査定では純正品であるかどうかが重要な基準となります。カスタマイズ（改造）好きなオーナーに取っては嬉しくないことですが、純正品は、その車の価値を決める際にプラス要素として大きな力を発揮します。
カスタム車は、中古車査定においてはマイナス査定であるのが一般的です。改造にはお金が掛かりますが、必ずしも一般的な価値として反映されません。なので、カスタムパーツ装着車は、なるべく純正パーツと取り替えてから査定を通し、売るようにするのが望ましいと言えます。
どうでも良さそうなシールやステッカーについても査定前に剥がしておくのが無難。メーカーオプションについても、ものによっては取り外しておく方が良い金額がでることもあります。
ポピュラーなオプションとしてカーステレオ等オーディオ機器、カーナビなどがありますが、これも純正品以外は良い査定は出ないと心得ておきましょう。
基本的にオーナーの趣味であるカスタムパーツは、誰でもが価値を見いだすわけではありません。趣味の世界であればむしろ好ましくないものと感じるかも知れません。たとえば、金額的に非常に高価なパーツもあるかも知れませんが、「これは高価なパーツなので、査定でも良い評価のハズ！」というのは大間違い、勝手な思い込みにすぎません。そのパーツが中古車販売店にとって、ありがたいものかどうかを考えてみてください。
査定基準には、個人の趣味は反映されません。元オーナーが「かっこいい！」と思っても、世間一般では案外「ダサイ」「無意味」と取られがちなものです。（ド派手なエアロや、爆音マフラーが代表的です）少々シビアで恐縮ですが、中古車査定の基準は最大公約数的なものであるものと理解しておきましょう。
なお、高価な改造部品は、ヤフオクや専門店で流すとそれなりの値段がつくものです。改造パーツは取り外して、純正部品に交換するのが基本と憶えておいてください。